پرداخت حقوق و مزایا و عائله مندی به جانبازان ، بازنشستگان ، وظیفه بگیران و مستمری بگیران وفق قانون و مقررات
پرداخت کسوربازنشستگی به کارکنان بازخرید ، مستعفی و اخراجی برابر قوانین و مقررات
انتقال کسور بازنشستگی کارکنان منتقله مشمولین قانون آجا اعم از سهم فرد و دولت به صندوق بازنشستگی وزارتخانه ها ، سازمانها ، ارگانها و ... منتقل شده و دریافت کسور کارکنان منتقله به ستاد کل، فرماندهی ، وزارتخانه ها ، سازمانها ، ارگانهای انتقال دهنده وفق مقررات
بیمه نمودن کارکنان شاغل تحت پوشش در قبال حوادثی که منجر به شهادت ، فوت ، بیماری ، نقص عضو یا از کار افتادگی شود مستند به قانون بیمه عمر و حوادث کارکنان و آئین نامه اجرائی مربوطه
ارائه انواع خدمت بیمه ای به افراد تحت پوشش مانند پرداخت کمک هزینه نگهداری به فرزندان معلول جسمی و ذهنی کارکنان ، پرداخت کمک هزینه درمان به بیماران صعب العلاج برابر مقررات مربوطه در مراکز درمانی داخل و یا خارج کشور
پیگیری در جهت تامین نیازهای اساسی جانبازان ، بازنشستگان ، وظیفه بگیران ، مستمری بگیران از قبیل مسکن ، بهداشت ، درمان ، مصرف و... از طریق سازمانهای ذیربط(بنیاد تعاون ، تعاونی های مسکن آجا ، سازمان تامین خدمات درمانی ، سازمان اتکا و ...)
ارائه خدمات خرسند ساز و فرهنگی و تفریحی با همکاری و هماهنگـی نیروها و سازمانها به جانبازان ، وظیفه بگیران ، بازنشستگان و مستمری بگیران
انجام پیش بینی های لازم مربوط به تهیه و تنظیم بودجه مورد نیاز جهت اجرای ماموریت سازمان و پیگیری آن تا مراحل تصویب
نگهداری حساب درآمد و هزینه سازمان مطابق با قوانین و مقررات
سرمایه گذاری از محل اندوخته های صندوق بازنشستگی و بیمه جهت تقویت بنیه مالی صندوق با هدف ارائه خدمات بهتر به کارکنان تحت پوشش
سرکشی و عیادت از جانبازان ، بازنشستگان در محل سکونت و مراکز درمانی
انجام وظایفی که به موجب تدابیر فرماندهی معظم کل قوا و قوانین و مقررات به عهده سازمان قرار دارد و می گیرد
تشکیل کمیسیونهای موضوع مواد 120 ، 121 ، 165 ، 172 و طرح پرونده های کارکنان بیمار صعب العلاج در شورایعالی پزشکی
رسیدگی به شکایات و دادخواستهای مشترکین و ارائه خدمات مشاوره ای به آنان
پرداخت وام کمک های بلاعوض از محل صندوق سود یک در هزار (قرض الحسنه سابوب) به کلیه کارکنان نیروهای مسلح اعم از شاغل و بازنشسته در چارچوب دستورالعملهای مربوطه
دریافت ارز لازم از ستاد وزارت بمنظور پرداخت هزینه معالجه کارکنان شاغل مشمول قانون آجا که بدلیل بیماری صعب العلاج لازم است به خارج از کشور اعزام شوند و انجام اقدامات اداری و مالی در رابطه با اعزام بیماران پس از تائید و شورایعالی پزشکی
انجام امور مربوط به معالجه بیماران صعب العلاج شاغل مشمول قانـون آجا در داخل کشور و پرداخت هزینه های معالجه پس از تائید شورا
ایجاد شرایط مناسب در جهت استفاده از روشهای نوین علمی در اجرای وظایف سازمان
تهیه و در سیر مراحل تصویب رساندن دستورالعملها و روشهای جاری (با هماهنگی مبادی ذیربط) در مورد آن تعداد از مواد قانونی و سایر مصوباتی که اجرای آنها موکد و یا نیازمند به تهیه دستورالعمل و روش جاری است
بررسی مشکلات ناشی از اجرای قوانین و مقررات یا آئین نامه ها و دستورالعملهای مورد عمل و ارائه پیشنهادات اصلاحی در جهت رفع مشکلات مزبور